本科知网查重原理是指本科生在知网系统中上传论文后，系统会通过比对已有的文献数据库，检测论文中是否存在与已有文献相似的部分。主要原理是通过文本比对技术，对论文进行全文扫描，找出相似度较高的部分，从而判断论文的原创性。

此外，本科知网查重原理还包括检测论文中的引用部分是否符合规范，以及排除一些常见的非原创性内容，如公式、图表、图片等。通过这些原理和方法，可以有效保证学术论文的独立性和学术诚信，确保学术研究的质量和可信度。